网易云课堂《医学方-科研系列课程》

 

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医学方精品课程---从数据挖掘--MIMIC--R语言基础--R语言作图--R语言高级医学统计--基因编辑--医学统计学，应有尽有。

课程目录

├──01-GEO、TCGA、Oncomine数据挖掘教程  

|   ├──数据挖掘代码  

|   ├──课时1 数据挖掘概述.mp4  188.52M

|   ├──课时10 TCGA数据整理和基因注释.avi  212.45M

|   ├──课时11 寻找差异基因和制作5年生存率.avi  340.84M

|   ├──课时12 Oncomine概述及Meta分析.avi  165.33M

|   ├──课时13 Oncomine之差异分析及共表达分析.avi  241.99M

|   ├──课时14 非cel格式GEO芯片数据分析.mp4  49.25M

|   ├──课时2 GEO在线工具的应用.avi  453.44M

|   ├──课时3 GEO数据下载和数据质量分析.avi  124.10M

|   ├──课时4 原始数据预处理.avi  193.68M

|   ├──课时5 寻找差异基因及制作热图和火山图.avi  287.24M

|   ├──课时6 富集分析.avi  268.23M

|   ├──课时7 KEGG分析.avi  221.56M

|   ├──课时8 蛋白互作网络.avi  215.52M

|   └──课时9 TCGA数据下载.avi  202.76M

├──02-MIMIC临床数据使用入门  

|   ├──MIMIC临床数据库使用入门 - 课时1-3.mp4  653.41M

|   ├──MIMIC临床数据库使用入门 - 课时4-5.mp4  517.14M

|   └──SQL QUERY.docx  20.09kb

├──03  R语言可视化及绘图  

|   ├──10、10.几何对象之点图.mp4  200.34M

|   ├──11、11.几何对象之条图.mp4  151.29M

|   ├──12、12.几何对象之盒形图和直方图.mp4  183.43M

|   ├──13、13.几何对象之线图.mp4  209.92M

|   ├──14、14.几何对象之标签绘制.mp4  159.91M

|   ├──15、15.坐标轴自定义函数.mp4  250.64M

|   ├──16、16.图例与标题.mp4  336.04M

|   ├──17、17.坐标系转换函数与图片分面函数.mp4  203.70M

|   ├──18、18.主题函数&一页多图&高质量图片导出.mp4  268.03M

|   ├──19、19.venn图和火山图.mp4  165.35M

|   ├──1、1.par函数.mp4  372.94M

|   ├──20、20.nomogram和heatmap.mp4  202.80M

|   ├──21、21.生存曲线.mp4  136.72M

|   ├──2、2.散点图&盒形图.mp4  348.12M

|   ├──3、3.条形图&直方图.mp4  289.30M

|   ├──4、4.饼图&克利夫兰点图&条件图.mp4  135.72M

|   ├──5、5.低级绘图函数(1).mp4  148.91M

|   ├──6、6.低级绘图函数（2）.mp4  207.66M

|   ├──7、7.图形颜色选取.mp4  125.59M

|   ├──8、8.ggplot2之qplot.mp4  191.72M

|   ├──9、9.ggplot2之美学函数.mp4  129.82M

|   └──医学方R语言可视化配套代码.pdf  609.25kb

├──04-R语言与高级医学统计学  

|   ├──1.mp4  43.24M

|   ├──10.mp4  33.94M

|   ├──11.mp4  27.33M

|   ├──12.mp4  69.65M

|   ├──13.mp4  39.54M

|   ├──14.mp4  27.70M

|   ├──15.mp4  41.72M

|   ├──16.mp4  28.95M

|   ├──17.mp4  101.69M

|   ├──18.mp4  49.26M

|   ├──19.mp4  24.28M

|   ├──2.mp4  64.55M

|   ├──20.mp4  34.75M

|   ├──21.mp4  61.85M

|   ├──22.mp4  39.28M

|   ├──23.mp4  72.21M

|   ├──24.mp4  35.98M

|   ├──25.mp4  40.63M

|   ├──26.mp4  34.81M

|   ├──27.mp4  60.56M

|   ├──28.mp4  34.96M

|   ├──29.mp4  34.63M

|   ├──3.mp4  26.30M

|   ├──30.mp4  52.54M

|   ├──31.mp4  54.16M

|   ├──32.mp4  34.73M

|   ├──33.mp4  55.90M

|   ├──4.mp4  45.85M

|   ├──5.mp4  54.24M

|   ├──6.mp4  75.73M

|   ├──7.mp4  60.51M

|   ├──8.mp4  30.01M

|   └──9.mp4  44.91M

├──05-豪斯医生数据挖掘之WGCNA详解  

|   ├──ClinicalTraits.txt  7.29kb

|   ├──epr.txt  32.77M

|   ├──课时01.使用cytoscape寻找核心基因.MP4  154.85M

|   ├──课时02.WGCNA理论和算法1.mp4  198.80M

|   ├──课时03.WGCNA理论和算法2.mp4  344.12M

|   ├──课时04.WGCNA理论和算法3.mp4  156.68M

|   ├──课时05.WGCNA理论和算法4.mp4  141.83M

|   ├──课时06.输入文件准备.mp4  349.12M

|   ├──课时07.寻找基因模块.mp4  245.05M

|   ├──课时08.与临床信息相结合.mp4  357.64M

|   ├──课时09.确定核心基因.mp4  299.69M

|   └──医学方豪斯医生WGCNA配套代码.pdf  126.18kb

├──06-数据挖掘—miRNA调节网络的构建  

|   ├──01、TCGA概述  

|   ├──02、构建调控关系理论  

|   ├──03、WGCNA理论  

|   ├──04、数据下载  

|   ├──05、提取蛋白编码基因  

|   ├──06、差异分析  

|   ├──07、基于算法构建调控  

|   ├──08、cytoscape构建网络  

|   ├──09、数据库预测  

|   └──医学方miRNA调节网络的构建配套代码  

├──07.医学方医学数据挖掘精品课程-手把手教您如何数据挖掘  

|   ├──10.TCGA数据整理和基因注释.mp4  347.76M

|   ├──11.寻找差异基因和制作5年生存率.mp4  592.51M

|   ├──12.Oncomine概述及Meta分析.mp4  323.72M

|   ├──13.Oncomine之差异分析及共表达分析.mp4  401.46M

|   ├──1数据挖掘概述.mp4  193.54M

|   ├──2.GEO在线工具的应用.mp4  300.16M

|   ├──3.GEO数据下载和数据质量分析.mp4  230.52M

|   ├──4.原始数据预处理.mp4  350.56M

|   ├──5.寻找差异基因及制作热图和火山图.mp4  412.54M

|   ├──6.GO富集分析.mp4  379.63M

|   ├──7.KEGG分析(修复).mp4  392.27M

|   ├──8.蛋白互作网络.mp4  306.82M

|   ├──9.TCGA数据下载.mp4  335.94M

|   └──课程脚本代码.zip  10.02kb

└──08-医学R语言快速入门与数据清洗  

|   ├──01.R语言、Rstudio简介.avi  323.01M

|   ├──02.R包的安装&向量.avi  155.96M

|   ├──03.数值型&逻辑型向量.avi  175.97M

|   ├──04.逻辑表达式&字符串向量.avi  104.45M

|   ├──05.因子型变量.avi  156.56M

|   ├──06.列表&矩阵.avi  136.66M

|   ├──07.数组&初识数据框.avi  123.17M

|   ├──08.数据框.avi  205.85M

|   ├──09.数据框的基本操作.avi  168.21M

|   ├──10.条件与循环.avi  132.56M

|   ├──11.自定义函数&数据读取.avi  219.17M

|   ├──12.数据的读取与写出.avi  137.69M

|   ├──13.数据排序与长宽型数据转换.avi  189.06M

|   ├──14.变量的因子化.avi  109.77M

|   ├──15.apply函数家族.avi  94.40M

|   ├──16.数据汇总函数.avi  140.85M

|   ├──17.plyr包.avi  200.95M

|   ├──18.dplyr包.avi  153.06M

|   ├──19.data.table包.avi  142.52M

|   ├──20.缺失值的识别与处理（1）.avi  132.71M

|   ├──21.缺失值的识别与处理（2）.avi  168.90M

|   ├──22.异常值和重复值的处理.avi  169.49M

|   ├──23.字符串的处理.avi  219.37M

|   ├──24.正则表达式.avi  163.93M

|   ├──25.stringr & stringi包.avi  213.38M

|   ├──26.时间与日期数据的处理.avi  254.77M

|   ├──27.lubridate包.avi  202.32M

|   ├──28.时间序列简介.avi  103.38M

|   ├──29.时间序列分析.avi  142.97M

|   ├──30.描述性统计.avi  156.57M

|   ├──31.t检验.avi  107.62M

|   ├──32.数据变换.avi  101.40M

|   ├──33.方差分析.avi  194.05M

|   ├──34.卡方检验.avi  108.91M

|   ├──35.回归分析与模型诊断.avi  211.16M

|   ├──36.模型诊断与Logistic回归.avi  118.25M

|   ├──37.生存分析与COX回归.avi  112.36M

|   └──R CODES.rtf  130.46kb